全额事业单位和差额事业单位的区别主要体现在含义、稳定性以及包括范围三个方面。

含义不同：全额拨款事业单位也称为全供事业单位，是其所需的事业经费全部由国家预算拨款的一种管理形式；差额拨款事业单位，按差额比例，财政承担部分，由财政列入预算；单位承担部分，由单位在税前列支，如医院等。

稳定性不同：对于全额事业单位而言，是相对稳定，是基于跟着国家进行调控，存在着一定的稳定性；而差额事业单位存在的变动可能性非常大，存在很大不确定的因素，因此也影响着工作的稳定性。

涉及范围不同：差额事业单位包括医院等有收入的又承担政府社会职能的单位；自收自支管理的事业单位，主要是一些原来国有企业的行业主管局。