1、经费来源不一样：公务员是行政编制，财政全额拨款。事业编制分三种，财政全额拨款，差额拨款，自收自支。2、待遇、地位不一样：行政编制地位最高、待遇最好。3、职能职责不同：理论上，公务员是”依法行政“的;而事业单位是全称是公益性事业单位。