机关单位与事业单位最主要的区别就是：机关单位的经费全部由国家负担，而事业单位的部分经费需要自己进行解决。事业单位一般是国家设置的带有一定的公益性质的机构，但不属于政府机构，与公务员是不同的。一般情况下国家会对这些事业单位予以财政补助，分为全额拨款事业单位、差额拨款事业单位。