初级药师合格分数线为60分每科。初级药师考试每个科目含100道试题，每题1分，考生答对1题计1分，也就是答对60题及以上的，就算单科合格了。初级药师总共考四个科目，在两个连续的考试年度内参加四个科目且四个科目成绩都在60分及60分以上的，就可以取得证书。
初级药师历年合格分数线如下：
2019年初级药师合格分数线：基础知识60分；相关专业知识60分；专业知识60分；专业实践能力60分。
2018年初级药师合格分数线：基础知识60分；相关专业知识60分；专业知识60分；专业实践能力60分。
2017年初级药师合格分数线：基础知识60分；相关专业知识60分；专业知识60分；专业实践能力60分。
2016年初级药师合格分数线：基础知识60分；相关专业知识60分；专业知识60分；专业实践能力60分。
